Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PtprbB2RU80 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PtprbB2RU80 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms