Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Nde1Q9CZA6 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Nde1Q9CZA6 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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