Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Krt71Q9R0H5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt71Q9R0H5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms