Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atad1Q9D5T0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atad1Q9D5T0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms