Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 IQG1YPL242C 4488 nt0.59□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 FMP27YLR454W 7887 nt0.58□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 YGR164WYGR164W 336 nt0.58□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 CSE1YGL238W 2883 nt0.55□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 NIP1YMR309C 2439 nt0.55□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 THO2YNL139C 4794 nt0.54□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 MLP1YKR095W 5628 nt0.54□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 RPS26AYGL189C 360 nt0.54□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 UTP10YJL109C 5310 nt0.54□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.53□□□□□ -2.32
CTF3Q12748 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt0.51□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 BUL2YML111W 2763 nt0.51□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 ORC3YLL004W 1851 nt0.5□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 ATP8Q0080 147 nt0.5□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 SBH1YER087C-B 249 nt0.5□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 YNL170WYNL170W 396 nt0.5□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 RPM2YML091C 3609 nt0.49□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 Q0092Q0092 141 nt0.48□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt0.48□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 SOM1YEL059C-A 225 nt0.47□□□□□ -2.33
CTF3Q12748 MLP2YIL149C 5040 nt0.46□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.45□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt0.43□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 YNL205CYNL205C 423 nt0.43□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 RCO1YMR075W 2055 nt0.42□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt0.42□□□□□ -2.34
CTF3Q12748 PMP2YEL017C-A 132 nt0.37□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 YBR099CYBR099C 384 nt0.37□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.37□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 snR69snR69 101 nt0.35□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 YNL266WYNL266W 420 nt0.35□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 EST1YLR233C 2100 nt0.34□□□□□ -2.35
CTF3Q12748 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.34□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt0.32□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 SEC10YLR166C 2616 nt0.32□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 YBR178WYBR178W 375 nt0.3□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 ESP1YGR098C 4893 nt0.3□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt0.28□□□□□ -2.36
CTF3Q12748 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt0.27□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 RDS3YPR094W 324 nt0.27□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.26□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.26□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt0.26□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
CTF3Q12748 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt0.19□□□□□ -2.38
CTF3Q12748 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt0.18□□□□□ -2.38
CTF3Q12748 SOV1YMR066W 2697 nt0.17□□□□□ -2.38
CTF3Q12748 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt0.14□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt0.13□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 snR50snR50 90 nt0.13□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 YER090C-AYER090C-A 90 nt0.12□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 snR45snR45 172 nt0.12□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 Q0143Q0143 153 nt0.11□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 snR128snR128 126 nt0.11□□□□□ -2.39
CTF3Q12748 snR61snR61 90 nt0.07□□□□□ -2.4
CTF3Q12748 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt0.07□□□□□ -2.4
CTF3Q12748 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt0.04□□□□□ -2.4
CTF3Q12748 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt0.04□□□□□ -2.4
CTF3Q12748 snR81snR81 201 nt0.02□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 snR85snR85 171 nt0.02□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt0.01□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 YML100W-AYML100W-A 174 nt0□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 snR67snR67 82 nt-0.02□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.02□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 YML054C-AYML054C-A 159 nt-0.02□□□□□ -2.41
CTF3Q12748 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-0.05□□□□□ -2.42
CTF3Q12748 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-0.07□□□□□ -2.42
CTF3Q12748 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-0.1□□□□□ -2.43
CTF3Q12748 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.12□□□□□ -2.43
CTF3Q12748 YMR326CYMR326C 309 nt-0.14□□□□□ -2.43
CTF3Q12748 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.16□□□□□ -2.43
CTF3Q12748 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-0.16□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 snR47snR47 99 nt-0.16□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 SBH2YER019C-A 267 nt-0.17□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 YHR217CYHR217C 462 nt-0.2□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 SKI7YOR076C 2244 nt-0.2□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 RPL41AYDL184C 78 nt-0.21□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 YBL109WYBL109W 336 nt-0.21□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-0.22□□□□□ -2.44
CTF3Q12748 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.23□□□□□ -2.45
CTF3Q12748 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-0.23□□□□□ -2.45
CTF3Q12748 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-0.23□□□□□ -2.45
CTF3Q12748 snR62snR62 100 nt-0.27□□□□□ -2.45
CTF3Q12748 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-0.3□□□□□ -2.46
CTF3Q12748 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-0.3□□□□□ -2.46
CTF3Q12748 snR38snR38 95 nt-0.33□□□□□ -2.46
CTF3Q12748 YKL225WYKL225W 348 nt-0.4□□□□□ -2.47
CTF3Q12748 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-0.43□□□□□ -2.48
CTF3Q12748 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-0.45□□□□□ -2.48
CTF3Q12748 snR161snR161 161 nt-0.46□□□□□ -2.48
CTF3Q12748 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-0.47□□□□□ -2.48
CTF3Q12748 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-0.48□□□□□ -2.49
CTF3Q12748 URB1YKL014C 5295 nt-0.51□□□□□ -2.49
CTF3Q12748 snR64snR64 101 nt-0.57□□□□□ -2.5
CTF3Q12748 YNR077CYNR077C 255 nt-0.6□□□□□ -2.51
CTF3Q12748 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-0.61□□□□□ -2.51
CTF3Q12748 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.63□□□□□ -2.51
CTF3Q12748 snR33snR33 183 nt-0.68□□□□□ -2.52
CTF3Q12748 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-0.69□□□□□ -2.52
CTF3Q12748 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
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