Protein–RNA interactions for Protein: Q12473

FRE6, Ferric reductase transmembrane component 6, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE6Q12473 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt-0.54□□□□□ -2.5
FRE6Q12473 YEL014CYEL014C 306 nt-0.57□□□□□ -2.5
FRE6Q12473 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-0.57□□□□□ -2.5
FRE6Q12473 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-0.58□□□□□ -2.5
FRE6Q12473 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-0.59□□□□□ -2.5
FRE6Q12473 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt-0.61□□□□□ -2.51
FRE6Q12473 YML100W-AYML100W-A 174 nt-0.62□□□□□ -2.51
FRE6Q12473 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.63□□□□□ -2.51
FRE6Q12473 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-0.64□□□□□ -2.51
FRE6Q12473 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-0.64□□□□□ -2.51
FRE6Q12473 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt-0.67□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt-0.68□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 snR39BsnR39B 96 nt-0.68□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 snR69snR69 101 nt-0.69□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 YOR302WYOR302W 78 nt-0.69□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-0.7□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 snR33snR33 183 nt-0.72□□□□□ -2.52
FRE6Q12473 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.77□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 PAU9YBL108C-A 129 nt-0.77□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 PMP2YEL017C-A 132 nt-0.78□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 RDS3YPR094W 324 nt-0.78□□□□□ -2.53
FRE6Q12473 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-0.79□□□□□ -2.54
FRE6Q12473 snR48snR48 113 nt-0.81□□□□□ -2.54
FRE6Q12473 YER090C-AYER090C-A 90 nt-0.82□□□□□ -2.54
FRE6Q12473 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-0.83□□□□□ -2.54
FRE6Q12473 snR52snR52 92 nt-0.91□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 YNL205CYNL205C 423 nt-0.92□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 snR80snR80 171 nt-0.93□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 YNL266WYNL266W 420 nt-0.94□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-0.96□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 snR50snR50 90 nt-0.97□□□□□ -2.56
FRE6Q12473 snR161snR161 161 nt-0.98□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 YOR102WYOR102W 351 nt-0.99□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.02□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-1.02□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-1.03□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 JLP2YMR132C 627 nt-1.03□□□□□ -2.57
FRE6Q12473 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-1.04□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.05□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 snR67snR67 82 nt-1.06□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 Q0142Q0142 177 nt-1.06□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 YNR077CYNR077C 255 nt-1.07□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-1.08□□□□□ -2.58
FRE6Q12473 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-1.11□□□□□ -2.59
FRE6Q12473 YBR178WYBR178W 375 nt-1.11□□□□□ -2.59
FRE6Q12473 SKI7YOR076C 2244 nt-1.13□□□□□ -2.59
FRE6Q12473 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-1.25□□□□□ -2.61
FRE6Q12473 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-1.25□□□□□ -2.61
FRE6Q12473 YNL198CYNL198C 303 nt-1.26□□□□□ -2.61
FRE6Q12473 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-1.28□□□□□ -2.61
FRE6Q12473 snR77snR77 88 nt-1.32□□□□□ -2.62
FRE6Q12473 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-1.32□□□□□ -2.62
FRE6Q12473 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.35□□□□□ -2.63
FRE6Q12473 YJL150WYJL150W 303 nt-1.35□□□□□ -2.63
FRE6Q12473 YML054C-AYML054C-A 159 nt-1.35□□□□□ -2.63
FRE6Q12473 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-1.42□□□□□ -2.64
FRE6Q12473 SOM1YEL059C-A 225 nt-1.43□□□□□ -2.64
FRE6Q12473 SPG3YDR504C 384 nt-1.44□□□□□ -2.64
FRE6Q12473 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-1.46□□□□□ -2.64
FRE6Q12473 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-1.48□□□□□ -2.65
FRE6Q12473 snR81snR81 201 nt-1.51□□□□□ -2.65
FRE6Q12473 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.51□□□□□ -2.65
FRE6Q12473 YBL053WYBL053W 375 nt-1.55□□□□□ -2.66
FRE6Q12473 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-1.55□□□□□ -2.66
FRE6Q12473 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-1.6□□□□□ -2.67
FRE6Q12473 YOR309CYOR309C 381 nt-1.71□□□□□ -2.68
FRE6Q12473 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-1.77□□□□□ -2.69
FRE6Q12473 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-1.81□□□□□ -2.7
FRE6Q12473 YGR151CYGR151C 336 nt-1.83□□□□□ -2.7
FRE6Q12473 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-1.83□□□□□ -2.7
FRE6Q12473 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.89□□□□□ -2.71
FRE6Q12473 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-1.9□□□□□ -2.71
FRE6Q12473 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-1.9□□□□□ -2.71
FRE6Q12473 RPL41AYDL184C 78 nt-1.93□□□□□ -2.72
FRE6Q12473 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-1.95□□□□□ -2.72
FRE6Q12473 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-1.98□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 snR38snR38 95 nt-2□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 snR6snR6 112 nt-2.01□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 YNL338WYNL338W 159 nt-2.01□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-2.03□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-2.03□□□□□ -2.73
FRE6Q12473 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-2.08□□□□□ -2.74
FRE6Q12473 YNL337WYNL337W 255 nt-2.12□□□□□ -2.75
FRE6Q12473 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-2.13□□□□□ -2.75
FRE6Q12473 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.13□□□□□ -2.75
FRE6Q12473 Q0032Q0032 291 nt-2.16□□□□□ -2.76
FRE6Q12473 snR73snR73 106 nt-2.16□□□□□ -2.76
FRE6Q12473 snR47snR47 99 nt-2.22□□□□□ -2.76
FRE6Q12473 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.35□□□□□ -2.79
FRE6Q12473 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-2.36□□□□□ -2.79
FRE6Q12473 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-2.41□□□□□ -2.8
FRE6Q12473 YKL225WYKL225W 348 nt-2.46□□□□□ -2.8
FRE6Q12473 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.46□□□□□ -2.8
FRE6Q12473 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-2.49□□□□□ -2.81
FRE6Q12473 YDR543CYDR543C 300 nt-2.49□□□□□ -2.81
FRE6Q12473 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-2.49□□□□□ -2.81
FRE6Q12473 snR85snR85 171 nt-2.57□□□□□ -2.82
FRE6Q12473 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.57□□□□□ -2.82
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