Protein–RNA interactions for Protein: Q12344

GYP5, GTPase-activating protein GYP5, yeastyeast

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GYP5Q12344 BRR2YER172C 6492 nt2.05□□□□□ -2.08
GYP5Q12344 YOR093CYOR093C 4947 nt2.05□□□□□ -2.08
GYP5Q12344 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.04□□□□□ -2.08
GYP5Q12344 MON2YNL297C 4911 nt2.02□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt2.02□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 NUP192YJL039C 5052 nt2.02□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 NUP188YML103C 4968 nt1.99□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 snR40snR40 97 nt1.99□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.99□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 TMA7YLR262C-A 195 nt1.98□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 PMD1YER132C 5262 nt1.98□□□□□ -2.09
GYP5Q12344 LAA1YJL207C 6045 nt1.96□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 CLU1YMR012W 3834 nt1.96□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 snR67snR67 82 nt1.95□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 CDC39YCR093W 6327 nt1.95□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 MLP2YIL149C 5040 nt1.94□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.91□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 FIG2YCR089W 4830 nt1.91□□□□□ -2.1
GYP5Q12344 BST1YFL025C 3090 nt1.89□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.88□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 VPS15YBR097W 4365 nt1.87□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 DNF3YMR162C 4971 nt1.87□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 SPT7YBR081C 3999 nt1.85□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 YGR130CYGR130C 2451 nt1.84□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 MEC1YBR136W 7107 nt1.84□□□□□ -2.11
GYP5Q12344 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.82□□□□□ -2.12
GYP5Q12344 YMR160WYMR160W 2451 nt1.8□□□□□ -2.12
GYP5Q12344 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.79□□□□□ -2.12
GYP5Q12344 VAM6YDL077C 3150 nt1.73□□□□□ -2.13
GYP5Q12344 IRA1YBR140C 9279 nt1.69□□□□□ -2.14
GYP5Q12344 YPR117WYPR117W 7470 nt1.68□□□□□ -2.14
GYP5Q12344 SSK2YNR031C 4740 nt1.65□□□□□ -2.14
GYP5Q12344 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.59□□□□□ -2.15
GYP5Q12344 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.58□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 CCH1YGR217W 6120 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.57□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 HKR1YDR420W 5409 nt1.55□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 IML1YJR138W 4755 nt1.54□□□□□ -2.16
GYP5Q12344 MYO1YHR023W 5787 nt1.52□□□□□ -2.17
GYP5Q12344 snR77snR77 88 nt1.51□□□□□ -2.17
GYP5Q12344 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.47□□□□□ -2.17
GYP5Q12344 RKR1YMR247C 4689 nt1.46□□□□□ -2.17
GYP5Q12344 BUD3YCL014W 4911 nt1.42□□□□□ -2.18
GYP5Q12344 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.41□□□□□ -2.18
GYP5Q12344 LTE1YAL024C 4308 nt1.39□□□□□ -2.19
GYP5Q12344 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.39□□□□□ -2.19
GYP5Q12344 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.39□□□□□ -2.19
GYP5Q12344 SBH2YER019C-A 267 nt1.37□□□□□ -2.19
GYP5Q12344 SCC2YDR180W 4482 nt1.34□□□□□ -2.19
GYP5Q12344 PAU24YBR301W 363 nt1.33□□□□□ -2.2
GYP5Q12344 SOV1YMR066W 2697 nt1.32□□□□□ -2.2
GYP5Q12344 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.27□□□□□ -2.21
GYP5Q12344 YJR029WYJR029W 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
GYP5Q12344 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.24□□□□□ -2.21
GYP5Q12344 BEM2YER155C 6504 nt1.2□□□□□ -2.22
GYP5Q12344 DOP1YDR141C 5097 nt1.2□□□□□ -2.22
GYP5Q12344 MLP1YKR095W 5628 nt1.19□□□□□ -2.22
GYP5Q12344 IQG1YPL242C 4488 nt1.1□□□□□ -2.23
GYP5Q12344 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.08□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 ESP1YGR098C 4893 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 YJL113WYJL113W 4647 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.04□□□□□ -2.24
GYP5Q12344 FMP27YLR454W 7887 nt0.93□□□□□ -2.26
GYP5Q12344 THO2YNL139C 4794 nt0.91□□□□□ -2.26
GYP5Q12344 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.89□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 UTP20YBL004W 7482 nt0.88□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt0.85□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 PAU9YBL108C-A 129 nt0.85□□□□□ -2.27
GYP5Q12344 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.78□□□□□ -2.28
GYP5Q12344 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
GYP5Q12344 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.73□□□□□ -2.29
GYP5Q12344 RPL41BYDL133C-A 78 nt0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.3 ms