Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 BST1YFL025C 3090 nt2.06□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 MEC1YBR136W 7107 nt2.04□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 SIP4YJL089W 2490 nt2.03□□□□□ -2.08
NOP53Q12080 BUL2YML111W 2763 nt2.03□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.02□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt2.02□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt2.01□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 CAT8YMR280C 4302 nt2□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt2□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 NST1YNL091W 3723 nt2□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 LAA1YJL207C 6045 nt1.99□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 IRA1YBR140C 9279 nt1.98□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 FIG2YCR089W 4830 nt1.97□□□□□ -2.09
NOP53Q12080 FYV8YGR196C 2454 nt1.96□□□□□ -2.1
NOP53Q12080 EST2YLR318W 2655 nt1.95□□□□□ -2.1
NOP53Q12080 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.93□□□□□ -2.1
NOP53Q12080 SPC110YDR356W 2835 nt1.9□□□□□ -2.1
NOP53Q12080 PET111YMR257C 2403 nt1.88□□□□□ -2.11
NOP53Q12080 SPT7YBR081C 3999 nt1.86□□□□□ -2.11
NOP53Q12080 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.85□□□□□ -2.11
NOP53Q12080 YGR130CYGR130C 2451 nt1.83□□□□□ -2.12
NOP53Q12080 BUD3YCL014W 4911 nt1.81□□□□□ -2.12
NOP53Q12080 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.79□□□□□ -2.12
NOP53Q12080 CLU1YMR012W 3834 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP53Q12080 CCH1YGR217W 6120 nt1.78□□□□□ -2.12
NOP53Q12080 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.76□□□□□ -2.13
NOP53Q12080 HKR1YDR420W 5409 nt1.75□□□□□ -2.13
NOP53Q12080 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.72□□□□□ -2.13
NOP53Q12080 RKR1YMR247C 4689 nt1.7□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 IML1YJR138W 4755 nt1.69□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.68□□□□□ -2.14
NOP53Q12080 snR67snR67 82 nt1.64□□□□□ -2.15
NOP53Q12080 VAM6YDL077C 3150 nt1.57□□□□□ -2.16
NOP53Q12080 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.52□□□□□ -2.17
NOP53Q12080 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.52□□□□□ -2.17
NOP53Q12080 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt1.51□□□□□ -2.17
NOP53Q12080 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt1.47□□□□□ -2.17
NOP53Q12080 YPR117WYPR117W 7470 nt1.45□□□□□ -2.18
NOP53Q12080 DOP1YDR141C 5097 nt1.45□□□□□ -2.18
NOP53Q12080 YJR029WYJR029W 5268 nt1.44□□□□□ -2.18
NOP53Q12080 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.44□□□□□ -2.18
NOP53Q12080 SCC2YDR180W 4482 nt1.4□□□□□ -2.18
NOP53Q12080 YMR160WYMR160W 2451 nt1.4□□□□□ -2.19
NOP53Q12080 LTE1YAL024C 4308 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP53Q12080 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP53Q12080 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP53Q12080 PAU24YBR301W 363 nt1.36□□□□□ -2.19
NOP53Q12080 MLP2YIL149C 5040 nt1.29□□□□□ -2.2
NOP53Q12080 BEM2YER155C 6504 nt1.28□□□□□ -2.2
NOP53Q12080 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.27□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.23□□□□□ -2.21
NOP53Q12080 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.18□□□□□ -2.22
NOP53Q12080 UTP20YBL004W 7482 nt1.14□□□□□ -2.23
NOP53Q12080 snR40snR40 97 nt1.14□□□□□ -2.23
NOP53Q12080 THO2YNL139C 4794 nt1.14□□□□□ -2.23
NOP53Q12080 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.04□□□□□ -2.24
NOP53Q12080 MLP1YKR095W 5628 nt1□□□□□ -2.25
NOP53Q12080 snR77snR77 88 nt1□□□□□ -2.25
NOP53Q12080 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.99□□□□□ -2.25
NOP53Q12080 YOL014WYOL014W 375 nt0.98□□□□□ -2.25
NOP53Q12080 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.98□□□□□ -2.25
NOP53Q12080 IQG1YPL242C 4488 nt0.93□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
NOP53Q12080 UTP10YJL109C 5310 nt0.9□□□□□ -2.27
NOP53Q12080 SBH2YER019C-A 267 nt0.9□□□□□ -2.27
NOP53Q12080 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.9□□□□□ -2.27
NOP53Q12080 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.88□□□□□ -2.27
NOP53Q12080 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.81□□□□□ -2.28
NOP53Q12080 SOV1YMR066W 2697 nt0.79□□□□□ -2.28
NOP53Q12080 PAU9YBL108C-A 129 nt0.76□□□□□ -2.29
NOP53Q12080 FMP27YLR454W 7887 nt0.75□□□□□ -2.29
NOP53Q12080 ESP1YGR098C 4893 nt0.7□□□□□ -2.3
NOP53Q12080 snR128snR128 126 nt0.65□□□□□ -2.31
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