Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm13E9PZZ1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms