Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Col9a3A2ACT7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms