Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm26992S4R1A3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm26992S4R1A3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm26992S4R1A3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm26992S4R1A3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm26992S4R1A3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm26992S4R1A3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms