Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp5Q9Z2P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vamp5Q9Z2P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vamp5Q9Z2P8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp5Q9Z2P8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms