Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ubl3Q9Z2M6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubl3Q9Z2M6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubl3Q9Z2M6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ubl3Q9Z2M6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubl3Q9Z2M6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubl3Q9Z2M6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms