Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E5

Atoh7, Protein atonal homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh7Q9Z2E5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atoh7Q9Z2E5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atoh7Q9Z2E5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atoh7Q9Z2E5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atoh7Q9Z2E5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh7Q9Z2E5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atoh7Q9Z2E5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atoh7Q9Z2E5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atoh7Q9Z2E5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atoh7Q9Z2E5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atoh7Q9Z2E5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atoh7Q9Z2E5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atoh7Q9Z2E5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms