Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfxankQ9Z205 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfxankQ9Z205 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RfxankQ9Z205 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RfxankQ9Z205 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RfxankQ9Z205 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RfxankQ9Z205 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms