Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T6

Pikfyve, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PikfyveQ9Z1T6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PikfyveQ9Z1T6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PikfyveQ9Z1T6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PikfyveQ9Z1T6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PikfyveQ9Z1T6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PikfyveQ9Z1T6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PikfyveQ9Z1T6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PikfyveQ9Z1T6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms