Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VarsQ9Z1Q9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VarsQ9Z1Q9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VarsQ9Z1Q9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VarsQ9Z1Q9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms