Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K7

Apc2, Adenomatous polyposis coli protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apc2Q9Z1K7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apc2Q9Z1K7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apc2Q9Z1K7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apc2Q9Z1K7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apc2Q9Z1K7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apc2Q9Z1K7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apc2Q9Z1K7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms