Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dctn3Q9Z0Y1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dctn3Q9Z0Y1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms