Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPS6KL1Q9Y6S9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPS6KL1Q9Y6S9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPS6KL1Q9Y6S9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPS6KL1Q9Y6S9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPS6KL1Q9Y6S9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms