Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N8

CDH10, Cadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH10Q9Y6N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH10Q9Y6N8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH10Q9Y6N8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH10Q9Y6N8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH10Q9Y6N8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH10Q9Y6N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms