Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCA3PQ9Y6N3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA3PQ9Y6N3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA3PQ9Y6N3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA3PQ9Y6N3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA3PQ9Y6N3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms