Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDY1Q9Y6F8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDY1Q9Y6F8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDY1Q9Y6F8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDY1Q9Y6F8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDY1Q9Y6F8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDY1Q9Y6F8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms