Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00312Q9Y6C7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00312Q9Y6C7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00312Q9Y6C7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms