Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC6Q9Y625 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPC6Q9Y625 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC6Q9Y625 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC6Q9Y625 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC6Q9Y625 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC6Q9Y625 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms