Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN10AQ9Y5Y9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN10AQ9Y5Y9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCN10AQ9Y5Y9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCN10AQ9Y5Y9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCN10AQ9Y5Y9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCN10AQ9Y5Y9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCN10AQ9Y5Y9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms