Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX5Q9Y5X3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX5Q9Y5X3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX5Q9Y5X3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX5Q9Y5X3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX5Q9Y5X3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms