Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX8Q9Y5X2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX8Q9Y5X2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX8Q9Y5X2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX8Q9Y5X2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX8Q9Y5X2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms