Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF18Q9Y5U5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF18Q9Y5U5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF18Q9Y5U5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF18Q9Y5U5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF18Q9Y5U5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms