Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL4A3BPQ9Y5P4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL4A3BPQ9Y5P4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL4A3BPQ9Y5P4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL4A3BPQ9Y5P4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL4A3BPQ9Y5P4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms