Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PHLDA3Q9Y5J5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PHLDA3Q9Y5J5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PHLDA3Q9Y5J5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PHLDA3Q9Y5J5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms