Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCL27Q9Y4X3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCL27Q9Y4X3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCL27Q9Y4X3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCL27Q9Y4X3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCL27Q9Y4X3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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