Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP15Q9Y4E8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP15Q9Y4E8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP15Q9Y4E8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP15Q9Y4E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP15Q9Y4E8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP15Q9Y4E8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms