Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR2E1Q9Y466 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NR2E1Q9Y466 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NR2E1Q9Y466 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR2E1Q9Y466 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NR2E1Q9Y466 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms