Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMED7Q9Y3B3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED7Q9Y3B3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED7Q9Y3B3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms