Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBE2J1Q9Y385 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2J1Q9Y385 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2J1Q9Y385 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2J1Q9Y385 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 746.7 ms