Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX24Q9Y343 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX24Q9Y343 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX24Q9Y343 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNX24Q9Y343 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX24Q9Y343 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms