Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W6

TDRKH, Tudor and KH domain-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRKHQ9Y2W6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TDRKHQ9Y2W6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TDRKHQ9Y2W6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRKHQ9Y2W6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TDRKHQ9Y2W6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TDRKHQ9Y2W6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 543.7 ms