Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 413.86□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.76e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 BRAF-205ENST00000497784 2336 ntTSL 59.67□□□□□ -0.866e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -16e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.26e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 26.84□□□□□ -1.316e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.576e-6■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.47e-7■■■■■ 34.1
DDX52Q9Y2R4 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 314.33□□□□□ -0.124e-13■■■■■ 33.9
DDX52Q9Y2R4 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.294e-13■■■■■ 33.9
DDX52Q9Y2R4 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 411.58□□□□□ -0.564e-13■■■■■ 33.9
DDX52Q9Y2R4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.784e-13■■■■■ 33.9
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 327.44■■□□□ 1.986e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 227.44■■□□□ 1.986e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.946e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 526.78■■□□□ 1.886e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.866e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.816e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 224.51■■□□□ 1.516e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.436e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 323.03■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 422.18■■□□□ 1.146e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.16e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 16e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 520.95■□□□□ 0.946e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 520.74■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 220.54■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 220.51■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 320.51■□□□□ 0.876e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 520.09■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 319.04■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 318.35■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 218.23■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 318.23■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 517.97■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 417.57■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 217.57■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 217.52■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.326e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 216.37■□□□□ 0.216e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 516.25■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 316.25■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 416.18■□□□□ 0.186e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 315.93■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 515.32■□□□□ 0.046e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 415.25■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 414.95□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 414.76□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 211.77□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 310.58□□□□□ -0.726e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 410.01□□□□□ -0.816e-6■■■■■ 33.8
DDX52Q9Y2R4 GPT2-204ENST00000562801 2092 ntTSL 217.94■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 33.7
DDX52Q9Y2R4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 33.7
DDX52Q9Y2R4 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 33.7
DDX52Q9Y2R4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.817e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GOLGA8A-205ENST00000569781 653 ntTSL 531.97■■■□□ 2.717e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 328.38■■■□□ 2.137e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.057e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)27.41■■□□□ 1.987e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 PRPSAP1-205ENST00000442767 908 ntTSL 527.34■■□□□ 1.977e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 527.07■■□□□ 1.927e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 226.42■■□□□ 1.827e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.817e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.87e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-208ENST00000523064 610 ntTSL 1 (best)25.53■■□□□ 1.687e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.67e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-224ENST00000638076 2323 ntTSL 1 (best)24.84■■□□□ 1.577e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 524.69■■□□□ 1.546e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 424.3■■□□□ 1.486e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.487e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.447e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.427e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-222ENST00000637667 874 ntTSL 1 (best)23.86■■□□□ 1.417e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.377e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.37e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 222.66■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 BAHCC1-204ENST00000583828 591 ntTSL 322.66■■□□□ 1.227e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GIPR-203ENST00000585889 1414 ntTSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.217e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-213ENST00000636212 1053 ntTSL 522.45■■□□□ 1.187e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.187e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 322.28■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 322.24■■□□□ 1.157e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.147e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-220ENST00000637450 868 ntTSL 321.94■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.17e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.087e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-210ENST00000635747 1181 ntTSL 521.67■■□□□ 1.067e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.057e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.017e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.967e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-215ENST00000586521 601 ntTSL 420.81■□□□□ 0.927e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 320.52■□□□□ 0.887e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-210ENST00000523414 668 ntTSL 220.49■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 33.6
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