Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A9

B3GNT3, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT3Q9Y2A9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
B3GNT3Q9Y2A9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
B3GNT3Q9Y2A9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
B3GNT3Q9Y2A9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT3Q9Y2A9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT3Q9Y2A9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT3Q9Y2A9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT3Q9Y2A9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT3Q9Y2A9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms