Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD1Q9Y239 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NOD1Q9Y239 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NOD1Q9Y239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NOD1Q9Y239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NOD1Q9Y239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOD1Q9Y239 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOD1Q9Y239 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NOD1Q9Y239 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NOD1Q9Y239 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms