Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HHLA3Q9XRX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HHLA3Q9XRX5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HHLA3Q9XRX5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HHLA3Q9XRX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms