Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc7Q9WVC5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc7Q9WVC5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trpc7Q9WVC5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpc7Q9WVC5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpc7Q9WVC5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpc7Q9WVC5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpc7Q9WVC5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpc7Q9WVC5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc7Q9WVC5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc7Q9WVC5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpc7Q9WVC5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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