Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atp1a4Q9WV27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1a4Q9WV27 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1a4Q9WV27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1a4Q9WV27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1a4Q9WV27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1a4Q9WV27 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1a4Q9WV27 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a4Q9WV27 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms