Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gabbr1Q9WV18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gabbr1Q9WV18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gabbr1Q9WV18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gabbr1Q9WV18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gabbr1Q9WV18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gabbr1Q9WV18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gabbr1Q9WV18 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gabbr1Q9WV18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms