Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bgrQ9WUZ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bgrQ9WUZ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sh3bgrQ9WUZ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sh3bgrQ9WUZ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sh3bgrQ9WUZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sh3bgrQ9WUZ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms