Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lhx9Q9WUH2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lhx9Q9WUH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lhx9Q9WUH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lhx9Q9WUH2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lhx9Q9WUH2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lhx9Q9WUH2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lhx9Q9WUH2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms