Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rbck1Q9WUB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbck1Q9WUB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbck1Q9WUB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbck1Q9WUB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbck1Q9WUB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbck1Q9WUB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms