Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scnn1bQ9WU38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scnn1bQ9WU38 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scnn1bQ9WU38 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Scnn1bQ9WU38 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Scnn1bQ9WU38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scnn1bQ9WU38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scnn1bQ9WU38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms