Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2AQ9UQM7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2AQ9UQM7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2AQ9UQM7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMK2AQ9UQM7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMK2AQ9UQM7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms